结构主旨《绥寇纪略》以纪事本末体例，各卷皆以三字为标题，分为〈渑池渡〉、〈车箱困〉、〈真宁恨〉、〈朱阳溃〉、〈黑水擒〉、〈谷城变〉、〈开县败〉、〈汴渠垫〉、〈通城击〉、〈盐亭诛〉、〈九江哀〉、〈虞渊沉〉等12卷。卷九〈通城击〉论李自成起义失败的原因。《明史》的「李自成传」多采用本书，徐鼐《小腆纪年附考》、查继佐《罪惟录·李自成传》、冯苏《见闻随笔·李自成传》、陈鹤《明纪》亦多采此书。关于成书年代，最早谈迁曾于顺至十一年（1654年）见过其稿本；嘉庆九年（1804年），有人附加补遗上、中、下三卷。
本书作者吴伟业系南方人，其记载多依赖他人口述，消息来源系「有亡自贼中来告状」者，又常为杨嗣昌、左良玉等维护。顾诚、姚雪垠皆曾考证出《绥寇纪略》许多记载如崇祯八年正月（1635年）的「荥阳大会」、「车箱困」等多属不实。